在商业合作中，合同的签署是非常关键的一环。通常情况下，合同上会加盖公司的公章或者合同专用章，以证明合同的真实性和合法性。那么，在涉及三方合作的情况下，是否可以使用合同专用章来签署合同呢？这个问题涉及到法律、公司管理和实际操作等多个层面。

首先，我们需要明确合同专用章的概念。合同专用章是企业为了特定用途而刻制的印章，主要用于签署合同或其他相关文件。它的使用范围一般限定在合同签订上，不同于企业的公章，后者具有更广泛的法律效力。

在三方合作的情况下，合同专用章的使用需要满足一定的条件和程序。一般来说：

1. 合同约定：在合同条款中明确指出可以使用合同专用章进行签署。这样可以在法律上保障合同的有效性。

2. 授权委托：如果是由代理人代为签署合同，则需要有明确的授权委托书，并且代理人需持有有效的身份证明。

3. 内部审批：根据公司的内部管理制度，可能还需要经过相应的审批流程，确保合同的合法性和合理性。

4. 备案登记：某些地区或行业可能要求将使用合同专用章的情况进行备案登记，以备后续核查。

5. 各方认可：所有参与方都需要对使用合同专用章的方式表示认可，并在合同文本上签字盖章确认。

需要注意的是，虽然合同专用章在很多情况下是可以使用的，但其法律效力可能会受到质疑。因此，在实际操作中，建议尽量使用公司的公章来签署重要合同，特别是在涉及金额较大或关系复杂的交易时。

此外，为了避免不必要的争议，建议在合同中明确规定：“本合同经甲乙丙三方共同确认后，可加盖各自单位的合同专用章作为有效签署。”这样既能保证合同的严肃性，又能简化签署流程。

总之，三方合作中是否可以使用合同专用章，取决于具体的法律规定、合同约定以及各方的实际需求。在签署合同时，务必谨慎对待，确保每一步都符合法律法规的要求，以免造成不必要的麻烦。